...следуя вашей логике можно прийти к выводу что командир ежедневно должен оббежать всех прибывших из отпусков, командировок и пр. для того чтобы убедиться что они прибыли своевременно....

В уставе написано, что командир за подчинённым должен бегать? Всё довольно чётко изложено
а затем в удобное время "забросить" рапорт о прибытии в строевую.
У нас было достаточно телефонного звонка.
Это возможно, не отрицаю, и я так иногда делал. Но не в удобное, а в то, которое позволит отдать в/сл приказом

И командиру можно позвонить, если его нет на месте и доложиться. Тоже без вопросов. Только не сидя дома,а находясь в части на рабочем месте с началом рабочего дня.
.думаю товарищу которому вменили ГДП за опоздание из отпуска достаточно фактами доказать что на службу он прибыл своевременно
Но вот пускай и доказывает. Никто же не препятствует
Основной отпуск