Не путать с судами апелляционной инстанции (в округах и флотах)! Они обсуждаются в теме:
Обжалование решения суда (апелляция)
Единственный Апелляционный военный суд находится во Власихе (Московская обл.)
https://vap.sudrf.ru/
Показать текст
Апелляционный военный суд в соответствии с установленной федеральными законами подсудностью рассматривает дела в качестве суда апелляционной инстанции по жалобам, представлениям на судебные акты окружных (флотских) военных судов, принятые ими в качестве суда первой инстанции и не вступившие в законную силу, а также дела по новым или вновь открывшимся обстоятельствам и осуществляет иные полномочия в соответствии с федеральными законами.
То есть в него обращаются только если судом первой инстанции был не гарнизонный суд, а окружной (флотский). К такой категории дел относятся, например, дела связанные с государственной тайной.