Куда писать рапорт - не на командира, т.к. деньги выдает ЕРЦ и командир не распоряжается такими выплатами. Собираемся брать билеты, но не известна как сама процедура "прошения денег" (у кого, как и как будет компенсироваться).
ИМХО. Вообще-то, если военнослужащий не знает, кто будет решать его вопрос, рапорт он обычно пишет так:
Прошу Вашего ходатайства перед Вышестоящим командованием о предоставлении (выделении) мне ... и дальше описываете, что просите! И пусть уже голова у команча дальше болит!

А Вы рядом

Это, кстати, его (команча) прямая обязанность решить данный вопрос!
Деньги могут выделяться целевым назначением (в Вашем случае, на приобретение билетов для следования в отпуск и обратно) или браться авансом (
аванс должен проходить по какой либо статье! - это важно - могут не дать! - тем более, что сейчас у очень многих расчеты идут через ЕРЦ и УФО)